Hoorcollege 2 microben

medium met veel voedingsstoffen, slecht gedefinieerd, vb: LB

complex medium met blood components

medium met goed gedefinieerde voedingsstoffen, vb: M9

medium dat selecteert op een organisme

microben die CO2 fixeren en hieruit koolstof voor organische moleculen halen

microben die voorgevormde organische moleculen gebruiken om andere organische moleculen te vormen

microben die licht als energiebron gebruiken

microben die redoxreacties als energiebron gebruiken

chemotrophs die anorganische moleculen als elektronenbron gebruiken

chemotrophs die organische moleculen als elektronenbron gebruiken

verzameling microben die afstammen van één cel

optische dichtheid bij 600 nm

manier om aantal kolonies te tellen dmv verdunningen

technologie die cellen kan onderscheiden op grootte en vorm

lag (blijvend laag), log (groeiend), stationary (blijvend hoog), death (dalend)

verdubbelingstijd van een populatie

formule om aantal cellen te berekenen adhv aantal generaties

vloeibaar medium in gesloten systeem, effecten van environmental changes onderzoeken

medium waarin cellen een steady state bereiken, bacteriële fysiologie onderzoeken

apparaat dat logaritmische groei in een continuous culture verzekert door het toevoegen/verwijderen van medium

laag met hechte structuur vol microben, vb: tandplak

soort biofilm

capsule rondom DNA bacterie, gevormd bij omgevingsstress door bacilli en clostridia

gedifferentieerde cellen in cyanobacteria N fixeren of fotosynthese uitvoeren, zo wordt N en O gescheiden

structuur die endospores vormt, 'glijdt' als vorm van transportatie, vb: Myxococcus xanthus

wortels in de grond/lucht

microben die in extreme omgevingen leven

microben die tussen 0 en 20 graden leven

microben die tussen 15 en 45 graden leven

microben die tussen 40 en 80 graden leven

microben die bij hoge druk leven

microben die bij hoge zoutconcentraties leven

microben die tussen 0 en 5 pH leven

microben die tussen 5 en 8 pH leven

microben die tussen 9 en 11 pH leven, vb: in soda/alkaline meren

microben die O2 gebruiken

microben die geen O2 gebruiken

microben die alleen in O2 kunnen leven

microben die niet in O2 kunnen leven

microben die met/zonder O2 kunnen leven

microben die alleen bij minder O2 leven

anaeroben die in O2 kunnen leven

manier om voedsel langer te bewaren door het kort te verhitten, meerdere tijd-temperatuur combinaties mogelijk

steriliserend

steriel

hoge temperaturen (evt autoclave incl druk), pasteurization, filtration, irradiation (straling), antiseptics

genetische resistentie, restrictie endonucleases, CRISPR integratie van faag DNA

microbe gebruiken om andere microbe te onderdrukken

microben die darmflora ondersteunen

gebruik van bacteriofagen om pathogenen te doden

overdracht van genetisch materiaal tussen twee organismen

opname van vrij DNA uit omgeving

bacterie die DNA in plant injecteert, gebruikt voor genetische modificatie

bacteriofagen verplaatsen DNA van een cel naar een andere cel

deel van DNA dat ontstaan lijkt door horizontal gene transfer, oa voor pathogeniciteit, resistentie en symbiose

afwisselen van uiterlijk om minder goed herkend te worden door immuunsysteem

proces start alleen als veel bacteriën samenwerken en veel autoinducer wordt herkend

bacteriën produceren samen licht, LuxR (eiwit dat autoinducer bindt) activeert transcriptie lux operon/luciferase

transformation, biofilm formation, bioluminescentie, virulentie

SSU rRNA kan gebruikt worden om stambomen te maken

ontdekte archaea als apart domein

microbe die methaan produceert

archaea zijn niet pathogeen, geen lipid bilayer maar verbonden monolayer, RNA/DNA polymerase als eukaryoten

virussen helpen in de koolstofkringloop

aantal gelyseerde cellen, veel bacteriofagen aanwezig

deel van bacteriofaag dat faaggenoom bevat

bacteriofaag doodt gastheercel, lysis vindt plaats

bacteriofaag is rustig, doet mee met bacteriële cyclus, faaggenoom repliceert

bacteriofaag in lysogenic cycle

bacteriofaag in chromosoom in gastheercel

verdedigingssysteem tegen vreemd DNA (vb: uit bacteriofaag), maakt vreemd DNA kapot

knipt DNA

methyleert DNA

bacterieel immuunsysteem, CRISPR-Cas knipt viraal DNA kapot, drie stadia: spacer aquisition, crRNA processing en effect